นักศึกษาระดับปริญญาโทและปริญญาเอกได้รับทุนการศึกษาจากสถาบันวิจัยของรัฐบาลและแหล่งทุนอื่น ๆ ดังนี้ สำนักงานกองทุนสนับสนุนการวิจัย (สกว.), สำนักงานคณะกรรมการวิจัยแห่งชาติ (วช.), คณะวิทยาศาสตร์ ม.อ., บัณฑิตวิทยาลัย ม.อ., สำนักวิจัยและพัฒนา (RDO) ม.อ., ทุนโครงการพัฒนาและส่งเสริมผู้มีความสามารถพิเศษทางวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี (ทุน พสวท.), โครงการปริญญาเอกกาญจนาภิเษก (คปก.), ศูนย์ความเป็นเลิศด้านนวัตกรรมทางเคมี (PERCH-CIC), ศูนย์ความเป็นเลิศด้านฟิสิกส์ (ThEP), ศูนย์ความเป็นเลิศโนเทคโนโลยีชีวภาพทางการแพทย์ มหาวิทยาลัยมหิดล (CEMB), สถาบันวิจัยและนวัตกรรมอาหาร ม.อ. (FIRIN) และ International Collaboration Fund (ICF) ประเทศมาเลเซีย